E3を使えず、激しく消耗しながら逃走を続けるヤシロ。城ヶ峰・セーラと共に公園へ逃げ込むが、トモエとセキに追いつかれてしまう。彼らはヤシロたちを生け捕りにするよう命じられていた。城ヶ峰はトモエと、セーラはセキと対峙するが、再び現れた追跡の犬からヤシロを守ろうとして、城ヶ峰が重傷を負ってしまう。追い詰められた勇者一行の前に、レヴィが姿を現す。

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《嵐の柩》卿との決戦に向けて、グーニーズへ車を走らせる勇者一行。《ハーフ・ドラゴン》のセキ・トモエ・ドリットは、モンスターの群れを投入して彼らを追撃する。ヤシロは残り1本となったE3を温存し、3人の弟子に戦闘を任せることに。驚異的なスピードで車に迫るドリットを印堂が迎え撃つ。さらに後方のセダンからは、槍を構えて身を乗り出すトモエの姿が。絶体絶命のピンチに、城ヶ峰が動く！

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鷹宮清人は《ハーフ・ドラゴン》でE4の研究開発を行っていた。組織から資金を提供された《明星の帳》卿は、城内でE4の適応実験を繰り返していたのだ。さらにヤシロは7年前、城ヶ峰の身に起こった衝撃的な事件について知る。東京に戻ったヤシロ一行は、戦場と化した街に降り立った。《嵐の柩》卿が消えたことで、勢力拡大を企む他の魔王たちが次々と抗争を起こしていたのだ。ヤシロは弟子たちに告げる。「稼ぎ時だ」――

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暗闇の中、激しく刃を交えるヤシロと《明星の帳》卿。鍔迫り合いで押されながらも、相手の太刀筋を冷静に見ていたヤシロは、形勢を逆転すべく奥の手を繰り出す。ヤシロVS《明星の帳》卿戦、いよいよ決着へ――！戦いの後、城ヶ峰・印堂・セーラの3人は、ヤシロからそれぞれの致命的な問題を指摘される。ヤシロは城で見た《ハーフ・ドラゴン》の研究データに載っていた、ある男の名前を思い出していた。

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《罅ぜる聖図》卿は圧倒的な力で、《明星の帳》卿の居城を攻撃。城内に突入した勇者と傭兵の混成部隊は、それぞれの能力を駆使して《明星の帳》卿を捜索する。ヤシロと弟子たちは乱戦をかいくぐり、不審なサーバールームにたどり着く。そこで彼らが見たものとは…。ついに《明星の帳》卿と遭遇したヤシロたちは戦闘を開始するが、《明星の帳》卿のエーテル知覚によって劣勢に立たされる。

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マルタと再会したヤシロ一行は、勇者温泉に泊まることに。宿の主人である《神父》は、ひとクセもふたクセもある危険な人物らしい。マルタはヤシロたちに、《明星の帳》卿が拠点とする城を攻めようと持ちかける。《明星の帳》卿の城は、かつて印堂を育てた傭兵部隊《北の篝火》を壊滅させた、化け物の巣窟になっているという。作戦会議の間でヤシロたちを待ち受けていたのは意外な人物だった。

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《ハーフ・ドラゴン》の情報を求めて、北海道に向かったヤシロと弟子たち。雪山を歩き続ける一行の前に、ギラギラのネオン看板を掲げた「勇者温泉」が出現する。そこで謎の男と遭遇したヤシロは、相手の思わぬ強さに意表を突かれる。一方、《諸手の楔》卿は独自のルートで《ハーフ・ドラゴン》の協力者と接触。魔王同士の抗争も激化していく。

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城ヶ峰と協力してイドを倒したヤシロ。印堂とセーラも残りのネフィリムを仕留め、パーティーの騒乱は幕を閉じた。しかし、戦いの最中に姿を消した《嵐の柩》卿はその後も消息不明。イシノオを殺すよう指示した黒幕の正体も、依然としてわからないままだ。
戦闘終結後、城ヶ峰の身に起きた驚愕の事態は新たな謎を生んだ。ヤシロの師匠・鷹宮清人は娘に何をしたのか。印堂の過去も明らかになり、物語は次のステージへ。

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印堂をかばって重傷を負ったヤシロは、弟子たちを指揮して連携プレーを取らせる。それぞれの欠点を補い合い、特性を活かす戦闘スタイルで、着実にネフィリムを倒していく3人。そんな中、満身創痍のヤシロに一体のネフィリムが襲いかかろうとする。ネフィリムを操るイドとレヴィも登場し、勇者一行の戦いはいよいよ佳境へーー！

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《嵐の柩》卿配下の黒服と対峙しながら、弟子3人に剣技の基本を教えるヤシロ。城ヶ峰・印堂・セーラはそれぞれ黒服の制圧を試みるが、あくまで敵を殺したくない城ヶ峰は苦戦を強いられる。必死に戦う彼女たちの前に、《嵐の柩》卿が姿を現した。ヤシロは《ハーフ・ドラゴン》の情報を引き出そうとするが、人型の異形が突如乱入し、状況は混沌を極めていく。

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ヤシロはイシノオが遺した最期のメッセージから、城ヶ峰・印堂・セーラの背後には《ハーフ・ドラゴン》につながる何かがあると直感する。BARグーニーズにやって来た城ヶ峰と印堂から、新たな特訓をせがまれたヤシロは、ある計画を思いつく。後日、弟子3人をともなったヤシロは、東京西部で最強とうたわれる大魔王《嵐の柩》卿のパーティー会場へと乗り込むのだった。

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イシノオの死に衝撃を受ける勇者たち。イドとレヴィがつけていた『割れた竜の顔』のバッジ、それは魔王同士の抗争を狙っている謎の組織《ハーフ・ドラゴン》のものだった。イシノオ殺害の黒幕の手がかりを求めて、文部科学省の魔王災害対策分室へ向かったヤシロは、とある政治家の息子に高額の賞金が懸けられていることを知る。その息子とは、数ヶ月前に戦った《諸手の楔》卿の部下で……。

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E3によって異様な力を発揮するイド。虎の子のバスタードソードを欠いた状態で応戦するヤシロは、訓練用の模造刀で必殺技を仕掛ける。気まぐれに城ヶ峰へ技の解説をしたことをきっかけに、彼女の父親とヤシロの意外な因縁が明らかになる。
不愉快な思い出を振り払うように、ヤシロはBARグーニーズへ戻るが……。

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城ヶ峰・印堂・セーラが通うアカデミーで、剣を使った実技試験が行われることになった。3人にとって実技試験は、進級か退学かを左右する重要なイベントである。ヤシロは自称「弟子」たちに稽古をつけるべく、夜のアカデミー校舎で特訓を開始する。激しい攻防を繰り広げながらも、的確に3人の欠点を指摘するヤシロ。ところが、そこで思わぬ敵と遭遇することになり……。

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ヤシロはセーラから、アカデミーの単位取得に必要な奉仕活動の監督役になってほしいと頼まれる。その奉仕活動とは、不審な集団に連れ去られた警察犬探し。行きがかり上、仕方なく捜索に付き合うことになったヤシロは、セーラと共に廃墟化したショッピングモールへ向かう。暗い建物内を進む2人を待ち受けていたのは、無数に光る目だった。

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イシノオの依頼で、いやいやながらも城ヶ峰の護衛を引き受けたヤシロ。彼女と新宿歌舞伎町のクラブに潜入して、《覗き屋》のマツギからE3を受け取り、「ある質問」をして帰るだけのはずだったが、E3を投与した男たちが少女2人を連れ込もうとしているところに遭遇し、またしても城ヶ峰の暴走が始まる！

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BARグーニーズでカードゲームに興じるヤシロのもとに、城ヶ峰・印堂・セーラが押しかけてくる。アカデミーで落第寸前の自分たちを「師匠」として指導してほしいというのだ。面倒なことに関わりたくないヤシロは3人を追い返すが、なおも諦めきれない印堂はヤシロを待ち伏せする。そんな時、ヤシロを付け狙う大魔王の眷属《諸手の楔》卿が襲いかかってきて……。

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魔王の人質になったセーラを救出するため、渋谷にある《琥珀の茨》卿の根城に向かうヤシロと城ヶ峰。次々と現れる敵を前に、ヤシロの異能が明らかになる。最奥の間にたどり着いたヤシロたちは、ついに《琥珀の茨》卿と対峙。しかし、予想外の出来事が起こり、ヤシロは絶体絶命のピンチに立たされる。その時、城ヶ峰がとった行動はーー。

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フリーランスの勇者《死神》ヤシロは、街のチンピラから勇者見習いの女子高生・城ヶ峰を助ける。行きつけのバーで飲んでいたヤシロのもとへ、先ほど助けた城ヶ峰とその同級生の印堂がやってくる。
城ヶ峰の話を聞くと、魔王《琥珀の茨》卿に連れ去られた友人を助けて欲しいと懇願される。